钩端螺旋体病需与流感、伤寒、流行性出血热、黄疸型肝炎、脑膜炎等疾病鉴别。
1. 流感：流感起病急骤，有高热、头痛、乏力、全身酸痛等症状，与钩端螺旋体病早期表现相似。但流感无钩端螺旋体病的结膜充血、腓肠肌压痛等体征，且无钩端螺旋体病的血清学特异性改变，通过病毒分离及血清学检查可鉴别。
2. 伤寒：伤寒持续发热、相对缓脉、全身中毒症状明显，有玫瑰疹、肝脾肿大等表现。钩端螺旋体病虽也有发热等症状，但伤寒血培养可发现伤寒杆菌，肥达反应阳性，而钩端螺旋体病血清学检查可发现特异性抗体，两者可区分。
3. 流行性出血热：流行性出血热有发热、出血、肾损害三大主症，与钩端螺旋体病有相似之处。不过出血热有典型的五期经过，特异性IgM抗体检测有助于鉴别，钩端螺旋体病则无此特征性抗体。
4. 黄疸型肝炎：黄疸型肝炎以黄疸、肝损害为主，钩端螺旋体病也可出现黄疸。但黄疸型肝炎无钩端螺旋体病的全身中毒症状、结膜充血、腓肠肌压痛等表现，且肝炎病毒标志物检查可辅助鉴别。
5. 脑膜炎：脑膜炎以头痛、呕吐、颈项强直等脑膜刺激征为主要表现，钩端螺旋体病脑膜脑炎型与之相似。然而脑膜炎脑脊液检查特点与钩端螺旋体病不同，且钩端螺旋体病有相应血清学改变可资鉴别。
日常生活中，在钩端螺旋体病流行地区要注意避免接触疫水，做好个人防护，如穿防护服、戴手套等。若出现发热等不适症状，应及时就医，配合医生进行相关检查，以便早期诊断和治疗，严格按照医生的嘱咐用药和进行后续康复。
