指甲凹凸不平可能是由营养不良、局部感染、外伤、皮肤病、全身性疾病等引起。
1. 营养不良：身体缺乏维生素A、钙、铁、锌等重要营养素时，指甲的正常生长会受到影响。维生素A对上皮组织的正常形成、发育与维持有重要作用，缺乏它指甲可能变得粗糙、凹凸不平；钙是构成指甲的主要成分之一，钙不足指甲质地会变差；铁参与血红蛋白合成，缺铁可能导致指甲变薄、凹陷；锌对新陈代谢有重要作用，缺乏锌会影响指甲细胞的分裂和生长。
2. 局部感染：真菌感染是常见原因，如灰指甲，真菌入侵甲板后，会破坏指甲的结构，使其变得凹凸不平、增厚、变色。细菌感染也可能引发甲沟炎等疾病，炎症影响指甲生长，造成凹凸现象。
3. 外伤：指甲受到挤压、碰撞等外伤，会损伤甲床。甲床是指甲生长的基础，受损后指甲在生长过程中就容易出现凹凸不平的情况，比如被门夹到手指，之后长出的指甲可能就会有问题。
4. 皮肤病：银屑病、扁平苔藓等皮肤病会累及指甲。银屑病患者的指甲可能出现点状凹陷，类似顶针样改变；扁平苔藓会导致指甲变薄、粗糙、凹凸不平，严重时指甲还可能萎缩。
5. 全身性疾病：一些全身性疾病也会反映在指甲上，比如贫血、甲状腺疾病等。贫血时指甲缺乏充足的血液供应，可能变得苍白、凹凸；甲状腺功能异常会影响身体的代谢，进而影响指甲的生长状态。
日常生活中要注意保持指甲清洁，避免过度修剪。饮食上保证营养均衡，多吃富含维生素和矿物质的食物。如果指甲凹凸不平情况持续不缓解或伴有其他不适症状，应及时就医，明确病因并遵医嘱治疗 。
