生殖器疱疹和梅毒在病原体、临床表现、传播途径、诊断方法、治疗方法上存在不同。
1. 病原体：生殖器疱疹由单纯疱疹病毒引起；梅毒由梅毒螺旋体感染所致。
2. 临床表现：生殖器疱疹常在外生殖器或肛门周围出现簇集或散在的小水疱，2～4 天后破溃形成糜烂或溃疡，自觉疼痛，常伴有腹股沟淋巴结肿痛、发热、头痛、乏力等全身症状，易复发；梅毒一期主要表现为硬下疳，为无痛性炎性硬结，表面发生坏死形成单个直径为 1～2cm、圆形或椭圆形的无痛性溃疡，边界清楚，周边水肿并隆起，基底呈肉红色，触之有软骨样硬度，二期梅毒可出现皮肤黏膜损害及骨膜炎、脑膜炎等多系统损害症状，三期梅毒可侵犯心血管、神经等重要脏器。
3. 传播途径：生殖器疱疹主要通过性接触传播，也可通过母婴传播；梅毒主要通过性接触传播、母婴传播和血液传播。
4. 诊断方法：生殖器疱疹主要依靠临床症状、实验室检查如单纯疱疹病毒核酸检测等来诊断；梅毒通过暗视野显微镜检查、梅毒血清学试验等进行诊断。
5. 治疗方法：生殖器疱疹以抗病毒治疗为主，常用药物有阿昔洛韦、伐昔洛韦等；梅毒治疗首选青霉素，如苄星青霉素、普鲁卡因青霉素等，对青霉素过敏者可选用头孢曲松钠等药物。
日常需注意保持良好的个人卫生习惯，避免高危性行为，防止疾病传播。若感染疾病，应积极配合治疗，严格遵医嘱用药，定期复查，以便及时了解病情变化和治疗效果。
