葡萄球菌和链球菌在形态结构、培养特性、生化反应、致病性、治疗方法上存在差异。
1. 形态结构：葡萄球菌呈球形，排列如葡萄串状，无芽孢、无鞭毛；链球菌呈球形或椭圆形，呈链状排列，无芽孢，无鞭毛，部分有荚膜。
2. 培养特性：葡萄球菌营养要求不高，在普通培养基上生长良好，可产生不同颜色的色素；链球菌营养要求较高，在含有血液或血清的培养基上生长良好，多数菌株产生溶血现象。
3. 生化反应：葡萄球菌能分解多种糖类，产酸不产气，触酶试验阳性；链球菌不分解菊糖，不被胆汁溶解，触酶试验阴性。
4. 致病性：葡萄球菌可引起局部化脓性感染、全身感染等，还可产生多种毒素；链球菌可引起化脓性炎症、猩红热、风湿热等疾病，致病物质主要有细胞壁成分、毒素和侵袭性酶类。
5. 治疗方法：葡萄球菌对青霉素等多种抗生素敏感，但耐药菌株日益增多，治疗时需根据药敏试验结果选择抗生素；链球菌对青霉素高度敏感，青霉素为治疗链球菌感染的首选药物。
日常需注意保持良好的个人卫生习惯，如勤洗手、勤换洗衣物等，减少细菌滋生和传播。对于感染患者，应严格遵医嘱使用抗生素，足量、足疗程用药，避免自行停药或换药，以防病情反复或产生耐药性。
