肛瘘不能自愈的原因主要有管道感染、内口存在、肛门括约肌影响、管道弯曲复杂、脓腔难以闭合等。
1. 管道感染：肛瘘形成后，其管道处于相对开放状态，外界细菌容易不断侵入，引发持续感染。感染得不到有效控制，炎症反复刺激，使得肛瘘难以自行愈合。
2. 内口存在：内口是肛瘘感染的源头，位于齿线附近的肛窦处。由于此处特殊的生理结构，容易藏污纳垢，不断有细菌进入并产生炎症，持续为肛瘘提供感染源，阻碍愈合。
3. 肛门括约肌影响：肛门括约肌不断收缩舒张，会影响肛瘘管道的愈合。其活动会导致管道内的渗出物难以排出，增加局部压力，不利于新生组织生长，破坏愈合环境。
4. 管道弯曲复杂：肛瘘的管道常常蜿蜒曲折，有的还存在分支，使得引流变得困难。渗出物无法顺畅排出，积聚在管道内，持续刺激周围组织，不利于伤口愈合。
5. 脓腔难以闭合：肛瘘形成过程中会产生脓腔，脓腔内有大量坏死组织和炎性渗出物。这些物质不清除，脓腔就无法自行闭合，进而导致肛瘘无法自愈。
肛瘘一旦形成，很难自行愈合，日常生活中要注意保持肛门清洁，避免久坐、久站，养成良好的排便习惯。若发现肛瘘症状，应及时就医，严格遵医嘱进行治疗，争取早日康复。
