胆囊萎缩会癌变，它是发生胆囊癌变的高危因素，需注意。除了这一点，胆囊萎缩还会带来其他危害表现，如导致胆囊收缩功能下降，影响胆汁正常排泄，胆汁淤积诱发其他疾病。
患有胆囊萎缩，如果治疗不及时或是不彻底，就会导致胆囊失去应有的功能，加重病情，随着病程进展，可诱发癌变。胆囊萎缩还会影响胆管和肝总管的解剖结构，导致胆管和肝总管的狭窄，出现胆管或肝总管粘连，从而影响患者健康。
胆囊萎缩是由于长期刺激而引起，若发病日久不治或治疗方式不当，可诱发并发症，以急性梗阻性黄疸、急性化脓性胆管炎常见。
1.急性化脓性胆管炎：胆囊萎缩导致胆汁无法进入胆囊，从而对胆管部位造成刺激，诱发急性化脓性胆管炎，患者常见表现为发热、腹痛、恶心欲呕、乏力等。
2.急性梗阻性黄疸：胆囊萎缩可能使胆囊储存和浓缩胆汁的功能丧失，如果胆汁长时间滞留在肝脏无法排出，可诱发急性梗阻性黄疸，患者常表现出黄疸症状，如：皮肤黄染、尿液发黄、黏膜发黄等。
胆囊萎缩的危害性很大，不仅会发生癌变，还会合并急性化脓性胆管炎或急性梗阻性黄疸，患者宜在胆囊萎缩发病早期进行有效治疗，避免病情加重，影响自身健康。建议患者日常饮食应避免高脂肪、高油、高盐，规律进食。