肛瘘恢复期一般在1个月到3个月左右。低位单纯性肛瘘恢复相对较快，可能1个月左右就能恢复；而高位复杂性肛瘘恢复时间较长，通常需要3个月左右。
肛瘘恢复时间存在差异是因为不同类型肛瘘的复杂程度不同。低位单纯性肛瘘瘘管位置低且简单，涉及的组织范围小，手术创面相对较小，术后创口愈合相对容易，所以恢复时间短。高位复杂性肛瘘瘘管位置深且走行复杂，可能涉及多个括约肌间隙，手术难度大，创面大且深，术后愈合过程中需要新生的组织多，愈合速度慢，因此恢复时间长。
在肛瘘恢复期间，创口的愈合是一个渐进的过程。术后初期，创口会有渗出、疼痛等情况，随着时间推移，渗出逐渐减少，肉芽组织开始生长填充创口。在此期间，换药十分关键，通过定期换药可以保持创口清洁，防止感染，促进创口从基底部逐渐愈合。同时，身体的营养状况也会影响恢复速度，营养充足能为创口愈合提供所需的物质基础，加快愈合进程。
肛瘘恢复期间要多休息，避免剧烈运动，防止创口裂开。饮食上多吃富含膳食纤维的食物，保持大便通畅，防止便秘或腹泻对创口造成刺激。还要按照医生要求定期复查和换药，以便及时发现并处理恢复过程中出现的问题，确保恢复顺利。
