奥硝唑和甲硝唑在作用机制、抗菌谱、药代动力学、不良反应、临床应用等方面存在不同。
1. 作用机制：奥硝唑和甲硝唑都属于硝基咪唑类抗菌药物，作用机制相似，都是通过使细菌细胞DNA螺旋结构断裂或阻止其合成，促使细菌死亡，但奥硝唑作用更迅速。
2. 抗菌谱：二者对厌氧菌都有抗菌活性，不过奥硝唑抗菌谱更广，对一些甲硝唑耐药的厌氧菌也有较好的抗菌效果，抗菌活性更强。
3. 药代动力学：奥硝唑半衰期较长，服药次数相对较少，患者依从性更好；甲硝唑半衰期短，需要多次服药来维持有效血药浓度。
4. 不良反应：甲硝唑不良反应相对较多，常见胃肠道反应如恶心、呕吐等，还可能有神经系统症状；奥硝唑不良反应相对较轻，耐受性更好。
5. 临床应用：都用于厌氧菌感染治疗，甲硝唑常用于口腔、妇科等常见厌氧菌感染；奥硝唑在治疗厌氧菌感染同时，对滴虫感染等也有较好疗效，在一些严重厌氧菌感染治疗中应用更广泛。
使用奥硝唑或甲硝唑时，要严格遵循医生的指导，按照规定的剂量和疗程用药。用药期间避免饮酒，因为可能引发双硫仑样反应，出现头痛、恶心等不适。若在用药过程中出现不良反应或症状未改善，应及时就医，以便调整治疗方案。
