多发性肾结石的治疗方法主要有药物排石、体外冲击波碎石、输尿管镜碎石取石术、经皮肾镜碎石取石术、开放手术等。
1. 药物排石：对于较小的多发性肾结石，药物排石有一定效果。因药物可调节尿液酸碱度，抑制结石形成并促进小结石溶解、排出。遵医嘱服用肾石通颗粒、金钱草颗粒、排石颗粒，通过增加尿量、改变尿液成分，促使结石随尿液排出体外，适用于直径较小且表面光滑的结石。
2. 体外冲击波碎石：利用高能冲击波聚焦后击碎体内的多发性肾结石。体外冲击波能精准作用于结石，将其粉碎成小块，使其更易随尿液排出。该方法无需开刀，对身体损伤较小，适合大多数直径在 2cm 以下的肾结石患者。
3. 输尿管镜碎石取石术：通过输尿管镜进入输尿管和肾盂，找到多发性肾结石后，利用激光或超声等能量源将结石击碎并取出。此方法直接作用于结石部位，能有效清除结石，对周围组织损伤相对较小，适用于输尿管上段及肾盂内的结石。
4. 经皮肾镜碎石取石术：在腰部建立通道直达肾脏，通过此通道插入肾镜，找到并击碎多发性肾结石。该方法可处理较大、复杂的肾结石，能直接将结石取出或粉碎后取出，提高结石清除率，常用于鹿角形结石等复杂结石情况。
5. 开放手术：当其他方法无法有效治疗多发性肾结石时采用。直接切开肾脏或输尿管，直视下取出结石。虽能彻底清除结石，但手术创伤大、恢复慢。适用于结石较大、合并严重梗阻或其他复杂情况，且其他治疗方法难以实施的患者。
多发性肾结石患者治疗后要注意日常护理。增加水分摄入，每日保证充足尿量，利于小结石排出和预防新结石形成。调整饮食结构，减少高草酸、高钙食物摄入，如菠菜、动物内脏等。定期复查肾脏超声等检查，监测结石复发及肾脏情况，若有不适及时就医。
