治疗毛囊炎的药物有抗生素类、抗真菌类、糖皮质激素类、维A酸类、中药等。
1. 抗生素类：适用于细菌感染引起的毛囊炎，常用的有莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等。莫匹罗星软膏对革兰阳性球菌有较强的抗菌活性，能有效抑制细菌蛋白质合成从而发挥杀菌作用；夫西地酸乳膏通过抑制细菌的蛋白质合成来达到抗菌效果，对葡萄球菌等有良好抗菌作用，可用于治疗脓疱疮、疖肿、毛囊炎等原发性皮肤细菌感染。
2. 抗真菌类：针对真菌感染导致的毛囊炎，如酮康唑乳膏、益康唑乳膏等。酮康唑乳膏能抑制真菌细胞膜麦角甾醇的生物合成，影响细胞膜的通透性，从而抑制真菌生长；益康唑乳膏对皮肤癣菌、酵母菌等有抗菌活性，可用于皮肤念珠菌病的治疗以及各种癣病。
3. 糖皮质激素类：在炎症明显且其他治疗效果不佳时使用，氢化可的松乳膏具有抗炎、抗过敏作用，能减轻局部炎症反应，缓解红肿、瘙痒等症状，但不宜长期、大面积使用，以免引起不良反应。
4. 维A酸类：如维甲酸乳膏，可调节毛囊角化、抑制皮脂腺分泌、抗炎等，有助于改善毛囊堵塞情况，对反复发作的毛囊炎有一定治疗作用，能促进皮肤细胞更新，使毛囊口通畅，减少细菌滋生。
5. 中药：一些中药也可用于治疗毛囊炎，如清热解毒、燥湿止痒类中药，可制成洗剂或药膏外用，如黄柏、苦参等中药材，通过其清热燥湿、解毒功效，对毛囊炎起到治疗作用。
治疗毛囊炎期间，要注意保持皮肤清洁卫生，避免搔抓、摩擦皮肤，防止加重感染。饮食上尽量避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，多吃新鲜蔬菜、水果，保持规律作息。同时，需严格按照医生的嘱咐用药，不要自行增减药量或停药，以确保治疗效果，促进病情早日康复 。
