含牙囊肿的发生可能是牙齿发育异常、牙外伤、炎症刺激、遗传因素、环境因素等因素，需要针对病因治疗，可采取的方法有手术治疗、药物辅助治疗等。
1. 牙齿发育异常：在牙齿发育过程中，牙釉质或牙本质的形成出现异常，导致牙冠与牙根之间的上皮剩余发生增殖，进而形成含牙囊肿。这种情况较为常见，通常需要手术完整摘除囊肿，以防止复发，术后需注意口腔卫生，定期复查。
2. 牙外伤：牙齿受到外力撞击等外伤后，牙髓组织受损，根尖周组织发生炎症，长期炎症刺激可引发含牙囊肿。对于此类情况，先评估外伤情况，若有牙齿松动等需进行固定。遵医嘱服用阿莫西林胶囊、甲硝唑片、布洛芬缓释胶囊，缓解炎症与疼痛，之后根据囊肿情况选择合适的手术时机。
3. 炎症刺激：口腔内长期存在的牙周炎、牙龈炎等炎症，炎症因子不断刺激周围组织，可能诱发含牙囊肿。要先积极治疗口腔炎症，通过洗牙等方式去除牙结石等刺激物，遵医嘱使用复方氯己定含漱液、碘甘油、丁硼乳膏，控制炎症后，再对囊肿进行手术处理。
4. 遗传因素：部分含牙囊肿患者存在家族遗传倾向，遗传基因导致机体对某些刺激更为敏感，易引发囊肿。对于有遗传背景的患者，除手术治疗囊肿外，家族成员也应定期进行口腔检查，以便早期发现问题，必要时采取预防性措施。
5. 环境因素：长期处于不良口腔环境，如口腔清洁不到位、食物残渣残留滋生细菌，或接触某些化学物质等，可能增加含牙囊肿的发病几率。要改善口腔环境，保持良好的口腔卫生习惯，早晚正确刷牙，饭后及时漱口，减少不良环境因素对口腔的刺激。
含牙囊肿治疗后，要保持规律作息，避免熬夜，饮食上避免食用辛辣、过硬的食物，以减轻对口腔的刺激。同时，严格按照医生要求定期复诊，以便及时发现异常情况并进行处理。
