治疗桥本氏甲状腺炎的中成药，主要有雷公藤多苷，昆明山海棠等，它可以降低患者血清内抗甲状腺过氧化物酶的水平，从而调控患者的自身免疫功能紊乱，但是一般对甲状腺的功能，没有有效的作用。
所以，当患者的甲状腺功能出现异常时，一般还需要用西药进行治疗。比如当患者出现桥本甲亢时，可以用硫脲类或者是米唑类药物抗甲状腺治疗，如果患者出现了甲减，可以用小剂量的左甲状腺素片进行治疗。在治疗的同时患者需要进行饮食控制以及适当的补硒。
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