磁共振造影剂的分类有很多的方法。在临床上，常用的分类法是根据磁敏感性的不同进行分类，以及根据造影剂特异性的不同来分类。
根据磁敏感性的不同，可以把磁共振造影剂分为抗磁性造影剂，顺磁性造影剂，铁磁性造影剂，以及超顺磁性造影剂，这些造影剂很多都是含钆、铁、锰的大分子有机化合物。顺磁性造影剂主要是缩短T1弛豫时间，在T1加权像上，显著性提高信号的强度，表现为T1高信号。超顺磁性的造影剂主要是缩短T2弛豫时间，表现为T2低信号。
根据造影剂特异性的不同，把磁共振造影剂还可以分为肝脏特异性造影剂、血池造影剂、淋巴结造影剂，以及针对胰腺或者肾上腺的特异性造影剂。
