结肠管状腺瘤根据不同部位，处理方法可能会有点差别，但是大致上，小的腺瘤可以通过结肠镜，直接在内镜底下做完整的切除。但是对于比较大的腺瘤，而且侵犯层次比较深的腺瘤，做内镜下切除有一定的手术风险，如术中出现肠穿孔。
需要通过腔镜再来修补，这样就能做到微创的办法来解决，但是风险较大。如腺瘤基础上，不能除外有恶性变者，建议通过腹腔镜来做局部切除，术中标本送冰冻病理，如果病理回报恶性，根据情况要做扩大切除，腹腔镜手术即可完成。
如果冰冻病理报告腺瘤没有恶性，局部切除即可，不需要再处理。所以微创手术是结肠管状腺瘤目前的主要治疗方式。
