肝S6段囊肿如果体积较小，没有出现明显的不适，通常不是特别严重。如果囊肿的体积持续增大，伴随明显的疼痛症状，也影响了正常的肝功能，说明病情比较严重。
肝S6段囊肿通常属于良性的病变，可能是先天性的，也有可能是肝脏部位受到过外伤或者感染引起的。如果囊肿的体积较小，一般不会出现明显的不适，比如疼痛、恶心等，因此病情不是特别严重，也不需要进行特殊的治疗，定期到医院进行相关的检查即可。
如果囊肿体积持续增大，而且伴随腹部饱胀、消化不良、上腹部隐痛、钝痛的症状，说明病情比较严重，得不到及时有效地治疗，可能会导致肝功能异常，还有可能会出现皮肤黏膜变黄的情况。此时病情比较严重，如果得不到及时有效地治疗，可能会发生腹膜炎、继发性感染等并发症。因此需要通过经皮肝囊肿穿刺引流术、囊肿去顶术等相关的手术进行治疗，有利于疾病的恢复。
