治疗扁桃体炎最有效的方法就是做扁桃体切除术，然而任何手术操作本身就具有创伤，一定会留下疤痕，只是这种疤痕增生往往发生在口腔，从外观上来看不会有明显变化。故而不用过于担心，更不要因为会留下疤痕而选择不做手术，这样反而会不利于身体健康。
从原则上来讲，手术操作本身就有创伤，留下疤痕是非常正常的。然而扁桃体切除手术是在口腔内部操作，面部并没有皮肤切口，所以从表面上来看不存在疤痕，这种疤痕增生往往发生在口腔。其次，扁桃体出现疤痕后容易给患者带来不适，其中最常见的为局部异物感，特别是在吞咽时非常明显，但随着时间的延长，疤痕可逐渐软化，这时异物感也逐渐消失。
因为每个人的体质不一样，扁桃体摘除术后留疤的严重程度也存在差别。例如疤痕体质的人群，留疤的程度会更重，且比正常人群更难以恢复。除此之外，本身炎症就很轻、周围组织粘连不严重的患者，手术操作的创伤会更小，疤痕自也不明显，当创面生长白膜后，白膜下的肉芽组织生长脱落，伤口就会以疤痕形式愈合。
