指甲上有凹陷小坑是否严重，不能一概而论，需要根据病因来决定，通常与指甲受伤、甲癣、手癣、银屑病甲、扁平苔藓等有关。
1.指甲受伤：当指甲受到打击或撞击时，会出现凹陷小坑。这种情况通常不严重，先用温水清洁伤口，然后涂抹适量的抗菌药膏或消炎药膏，再用无纺布或创伤敷料进行包扎。
2.甲癣：甲癣通常不严重，但是会影响美观，如果能够足够重视病情，积极采取治疗措施，临床上可遵医嘱口服盐酸特比萘芬片、伊曲康唑胶囊等抗真菌药物，一般能缓解症状。
3.手癣：部分患者出现手癣后由于手部皮肤和指甲受到真菌感染，可能会导致此种症状产生，通常不严重，可达到临床治愈，但是会复发。可以在医生的指导下使用特比萘芬软膏、舍他康唑乳膏等药物治疗。
4.银屑病甲：一种以红斑丘疹鳞屑为主的皮肤病，大约90%的银屑病患者有甲受累，约5%的患者只有甲受累，没有其他的银屑病表现，银屑病甲常见“顶针状”凹陷或油滴样。银屑病甲通常是比较严重的，会对指甲造成较大伤害，可遵医嘱局部外用药物、系统口服、物理治疗等。外用卡泊三醇软膏、阿维A胶囊等药物治疗。
5.扁平苔藓：是发生在皮肤、毛囊、黏膜、指趾等部位的特发性炎症性皮肤病，其典型症状是多角形紫红色、扁平丘疹，扁平苔藓导致甲损害的发生率在5%~10%，其临床表现为甲板增厚或变薄、甲凹凸不平、表面粗糙，常有纵沟，罕见有进行性萎缩。扁平苔藓一般指比较严重的，会影响美观，带来心理负担。可口服抗组胺药依巴斯汀片止痒，局部外用卤米松乳膏。
除此之外，还有可能是低氧血症、类风湿关节炎和系统性红斑狼疮等导致的。应积极就医进行规范的检查，并根据检查结果进行针对性的治疗，以免病情加重，对机体造成严重的伤害。平时可以多吃一些富含营养的食物，包括豆类、奶类、蛋类、鱼类及瓜果蔬菜等，不要挑食、偏食，以免营养摄入不充足，影响机体健康。
