舌头右侧最里面底部疼一般是口腔溃疡、舌乳头炎、舌咽神经痛等原因引起，治疗方法通常有药物治疗。
1.口腔溃疡：口腔溃疡主要发生在舌头边和唇内，如果这些部位出现口腔溃疡，就会出现水肿、充血和疼痛等不适感。在医生的指导下使用口腔溃疡散和意可贴等进行治疗，治疗期间不要用舌头舔舐患处，注意及时补充水分。
2.舌乳头炎：舌头右侧最里面底部疼可能与舌乳头炎有关，会表现出疼痛、肿胀的症状。患者在医生的指导下服用葡萄糖酸锌和维生素B等药物进行治疗，建议平时多吃维生素含量高的水果蔬菜。
3.舌咽神经痛：这种疾病主要在舌根、咽喉和舌头最里面等这些部位，发生在这些部位会引起阵发性的疼痛，有针刺或刀刺样的疼痛表现。及时在医生的指导下服用维生素B1和维生素B12等药物进行治疗，饮食上要避免咀嚼硬的食物，减少使用下颌关节。
除了以上三种原因之外，也存在其他的可能性，比如过锐的牙齿牙尖、不良修复体等形成的刺激。在日常生活中要避免吃辛辣刺激的食物，注意口腔卫生，坚持早晚刷牙，注意不要熬夜，作息要规律，避免过度劳累。
