生殖器疱疹和天疱疮的区别有很多，包括疾病的定义不同、病因不同、症状不同等。
1.疾病的定义不同
生殖器疱疹是常见的性传播疾病，是由单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器官导致的，常常以慢性、反复发作的特点，通常难以治愈。天疱疮是一种自身免疫性大疱性疾病，是由表皮内棘层松解导致的皮肤疾病。
2.病因不同
引起天疱疮的因素常常和免疫系统紊乱有密切关系，免疫细胞对自身组织发生攻击，会破坏身体的自身稳定性，最终引起天疱疮。除此之外，部分药物也会增加天疱疮的发生率，尤其是含氢硫基团的药物。生殖器疱疹的诱发因素和病毒感染有关，比如HSV-1、HSV-2，病毒可通过性生活、口腔进行传播。
3.症状不同
天疱疮初发皮肤上会出现小水泡，随着时间的推移，会导致皮损发生糜烂和溃疡，并伴随局部有烧灼和瘙痒感、腹股沟淋巴结肿痛、发热、头痛等。不同类型的天疱疮出现的皮损是不一样的，比如寻常型天疱疮表现为皮肤上出现水疱或大疱，疱壁薄弱，容易发生破溃，渗液较多。增殖性天疱疮皮损最初是薄壁水疤，在糜烂的表面会出现乳头状增殖。
由此可见，天疱疮和生殖器疱疹是完全不同的疾病，在平时要做好区别，避免走入治疗误区。另外在发病期间要积极配合医生治疗，定期复查，密切监测病情。天疱疮患者如果出现口腔损害时，还要注意口腔的卫生和护理。
