没有明确数据和研究表明灭活疫苗在体内多久会消失，大部分会在几天到数周内代谢完，但其产生的免疫反应可能会持续数月、一年到数年不等，有的则是终身免疫。
灭活疫苗是通过细胞基质对病毒进行培养后将病毒杀死、保持抗原颗粒完整性、使其失去致病力而保留抗原性后制作而成的疫苗，如脊髓灰质炎灭活疫苗、乙型脑炎灭活疫苗、流行性感冒疫苗等，都属于灭活疫苗。在接种该类疫苗后，其在短时间内就被机体吸收代谢，几天到数周内随着代谢排出体外。
但疫苗代谢并不等于失效，该类疫苗注射进入体内后，就会作用于机体免疫系统并生成大量抗体，使身体产生对抗某一种病毒和细菌的能力，其抗体有效时间持续较长，可能会在数月后逐渐下降，也可能会持续一年、数年不等。如流行性感冒疫苗可持续8~12个月，而脊髓灰质炎灭活疫苗则是终身免疫。
建议在接种灭活疫苗前，详细咨询医生相关事项，如需要接种几剂、每次接种时间、抗体持续时间等。在开始接种后，应遵照医嘱完成全程接种，同时也需加强个人生活护理。如果一次接种出现不良反应，需及时与医生沟通，必要时可终止接种。
