新生儿不建议长期吃益生菌。长期吃益生菌可能会导致新生儿肠道菌群失衡，也可能会对益生菌产生依赖。
人体的肠道中本身就有很多菌群，如果这些菌群平衡的情况下，胃肠道才能健康，如果菌群失调，新生儿会出现便秘或腹泻的情况。而益生菌是一种有益于消化吸收的菌，能够平衡身体的内环境，同时有助于消化、吸收，凭借益生菌的作用，可以调节肠道的环境，改善新生儿便秘、腹泻的情况。但如果长期吃益生菌，不利于自己肠道益生菌的产生和平衡，并且可能会导致新生儿对益生菌产生依赖，不利于肠道健康。
正常情况下吃一段时间益生菌后如果已经没有不适症状，要停止食用，新生儿可以通过自己内平衡的调节能力，使肠道功能恢复正常。
