口腔黏膜囊肿可能是与先天发育、不良饮食习惯、感染等有关，在治疗方面可以使用一般疗法、药物疗法以及手术疗法处理。
1.先天发育：在胚胎发育期间，骨和骨的接缝处会形成上皮，当上皮到骨和骨之间时，会逐渐分泌液体，引发口腔黏膜囊肿。若囊肿体积较大，可以配合医生采用手术或者全麻手术来切除处理。
2.不良饮食习惯：饮食上经常进食过硬的食物，可能会导致局部频繁受到摩擦，长时间下去黏膜下腺体破裂、堵塞，腺体分泌物滞留在腺泡内引发的。应该及时调整饮食，可以适当多吃些软食。
3.感染：如果口腔黏膜受到细菌感染，且感染比较严重，感染一直没有得到控制，长时间下去可能会诱发该疾病。可以由医生指导服用阿莫西林分散片、头孢克肟片等药物。
此外，还可能是与口腔黏膜溃疡、口腔肿瘤等有关。如果不适症状比较严重，建议就医诊治。平时在生活中，要注意做好口腔卫生的护理工作。
