3岁小孩手上起小疙瘩可能是由蚊虫叮咬、湿疹、接触性皮炎、汗疱疹、手足口病等因素所致，应根据医生指导，选择药物对症治疗。
1.蚊虫叮咬：如果在户外活动时，手受到蚊虫叮咬后，局部皮肤出现变态反应，出现风团样丘疹，丘疹尖端有小水泡，常伴随瘙痒症状。可以根据医生指导，选择复方薄荷脑软膏、复方樟脑乳膏等清凉舒缓类药物局部涂抹，缓解瘙痒。
2.湿疹：湿疹的具体发病因素尚不明确，3岁孩子接触到过敏原，可能引起手部湿疹发作，出现粟粒大小的丘疹、水疱、丘疱疹。建议遵从医嘱，使用炉甘石洗剂、硼酸洗液等消炎药物局部清洗，缓解症状。
3.接触性皮炎：如果免疫能力较弱，手部接触到有毒物质、刺激性物质可能会引起皮肤黏膜出现炎症反应，手上出现针尖大小的丘疹、水疱，排列较为密集，会出现瘙痒、刺痛、灼痛等自觉感受。可根据医生的指导，选择莫匹罗星软膏、红霉素软膏等药物局部涂抹预防感染。
4.汗疱疹：汗疱疹的发病因素尚不明确，3岁孩子的皮肤保护屏障较为薄弱，可能出现汗疱疹。手足部会出现对称性的水疱，伴随剧烈瘙痒、灼烧痛感。应根据医生的治疗意见，使用水杨酸软膏、尿素乳膏等保湿软膏预防皮肤干燥脱皮。
5.手足口病：肠道病毒感染引起手足口病，3岁小孩是该类疾病的高发人群，患儿的手、足、口腔等部位会出现散在皮疹、疱疹，伴随发热、食欲下降等症状。应及时根据医生的指导，使用磷酸奥司他韦颗粒、利巴韦林颗粒等抗病毒药物进行治疗。
建议出现小疙瘩时应避免搔抓，以免引起皮肤组织溃烂，加重病情。如果出现发热、渗液、糜烂等情况时，应及时就医面诊，对症治疗。
