阴茎根部皮肤疼痛可能是外界因素、过度手淫、毛囊炎、前列腺炎、精索静脉曲张等引起的，可针对不同的原因采取一般治疗、局部用药、全身用药、物理治疗、手术治疗等。若症状持续不能缓解，可及时到医院就诊。
1.外界因素：可能是因为局部皮肤反复受到摩擦或刺激引起的，应暂时避免摩擦和刺激，穿着宽松的衣物，会逐渐恢复。
2.过度手淫：如果过度手淫，阴茎根部的肌肉会反复收缩，可能会牵扯到皮肤，引起皮肤和肌肉疼痛。应控制手淫的次数，并注意休息。
3.毛囊炎：如果局部皮肤有红肿，可能是毛囊炎导致的，是一种细菌感染性皮肤疾病，可遵医嘱局部使用抗生素药物治疗，例如红霉素软膏、莫匹罗星软膏等，可促进炎症消退。
4.前列腺炎：当患有前列腺炎时，由于炎症较为严重，可能会刺激到尿道部神经，引起阴茎根部疼痛。可遵医嘱服用抗生素药物治疗，例如盐酸左氧氟沙星片、头孢克肟分散片等。
5.精索静脉曲张：如果患有精索静脉曲张，也会导致阴茎根部皮肤疼痛，并伴随着阴囊坠痛症状，可以采取物理治疗方法，例如局部冷敷、使用阴囊托等。当精索静脉曲张较为严重时，可能需要采取手术治疗，例如精索静脉高位结扎术。
此外，也有可能是其他原因引起的，例如尿道结石。平时应注意对阴茎部位的保护，避免穿过紧的内裤，容易导致局部血液循环不畅。
