金匮肾气丸和济生肾气丸区别有成分不同、作用不同、适应症不同、药理作用不同、使用禁忌不同等，患者需就医后按照医生要求选择药物。
1.成分不同：金匮肾气丸由熟地黄、山药、山茱萸等组成，主要针对肾阴虚的症状。济生肾气丸在金匮肾气丸的基础上加入牛膝和车前子，使其功效更偏向于补肾阳虚，同时兼顾肾阴虚。
2.作用不同：金匮肾气丸主要用于温补肾阳，对于肾阴虚的症状如腰膝酸软、头晕耳鸣等有较好的疗效。济生肾气丸则在补肾阳的同时，还具有利水消肿的作用，适用于肾阳虚引起的水肿、小便不利等症状。
3.适应症不同：金匮肾气丸适用于肾阴虚引起的一系列症状，如潮热盗汗、遗精早泄等。济生肾气丸则更适用于肾阳虚引起的症状，如腰膝冷痛、畏寒肢冷、性功能减退等，同时对老年性阴道炎、慢性肾炎等也有一定的治疗作用。
4.药理作用不同：金匮肾气丸主要通过补益肾阴来发挥作用，对于肾阴虚的人群有较好的调理效果。济生肾气丸则通过补益肾阳和利水消肿来发挥作用，对于肾阳虚的人群有更好的治疗效果。
5.使用禁忌不同：金匮肾气丸以滋阴为主，对于体内有痰湿、瘀血等情况的人群不宜使用。济生肾气丸则偏于补阳，对于体内有热邪、湿热等情况的人群不宜使用。
