衡量蛋白质利用率的指标有生物价、蛋白质功效比值、氨基酸评分、净利用率等。
1. 生物价：反映食物蛋白质消化吸收后，被机体利用程度的指标。生物价越高，表明其被机体利用程度越高，最大值为100。它是通过测定食物蛋白质在体内的氮储留量与氮吸收量来计算得出的，能较好地反映蛋白质在体内的利用情况。
2. 蛋白质功效比值：是用处于生长阶段的幼年动物在实验期内，其体重增加和摄入蛋白质的量的比值来反映蛋白质营养价值的指标。一般来说，比值越高，说明该蛋白质的营养价值越高，对动物生长的促进作用越明显。常用于评价食物蛋白质对动物生长发育的支持能力。
3. 氨基酸评分：也叫蛋白质化学评分，是用被测食物蛋白质的必需氨基酸评分模式和推荐的理想模式或参考蛋白的模式进行比较，找出最缺乏的那种必需氨基酸，即第一限制氨基酸，然后计算出该种氨基酸的实际含量与理想模式中该氨基酸含量的比值，以此来评定蛋白质的营养价值。
4. 净利用率：表示摄入蛋白质在体内被利用的情况，它把食物蛋白质的消化和利用两个方面都考虑进去，更全面地反映了蛋白质的实际利用程度。其数值是通过测定食物蛋白质的氮储留量与氮摄入量来计算得到的。
在评估蛋白质利用率时，要结合多种指标综合判断，同时考虑个体的年龄、健康状况、饮食习惯等因素。对于特殊人群，如患有某些疾病或处于特殊生理阶段的人，应根据自身实际情况合理选择蛋白质来源。
