眼睛真菌感染常见的药物有那他霉素滴眼液、氟康唑滴眼液、两性霉素B滴眼液、伊曲康唑胶囊、伏立康唑注射液等。
1. 那他霉素滴眼液：是一种多烯类抗真菌药物，对多种眼部致病真菌有良好的抗菌活性。主要通过与真菌细胞膜上的固醇结合，改变细胞膜的通透性，使细胞内重要物质外漏，从而起到杀菌或抑菌作用。在临床上，常用于治疗真菌性角膜炎等眼部真菌感染疾病，能有效控制病情发展，缓解眼部不适症状。
2. 氟康唑滴眼液：属于三唑类抗真菌药，通过抑制真菌细胞色素P - 450依赖酶，干扰真菌细胞膜主要成分麦角固醇的合成，破坏真菌细胞膜的完整性，达到抗真菌的目的。对于念珠菌属、隐球菌属等引起的眼部真菌感染有较好的疗效，使用方便，局部应用能在眼部维持一定的药物浓度。
3. 两性霉素B滴眼液：为多烯类抗真菌抗生素，能与真菌细胞膜上的麦角固醇结合，增加细胞膜的通透性，导致细胞内物质外漏而死亡。对多种深部真菌如新型隐球菌、白色念珠菌等有强大的抗菌作用，常用于治疗严重的眼部真菌感染，但由于其刺激性较强，可能会引起眼部疼痛等不良反应。
4. 伊曲康唑胶囊：是一种口服的三唑类抗真菌药物，具有广谱抗真菌活性。口服后在体内分布广泛，能渗透到眼部组织，对于一些深部眼部真菌感染或全身性真菌感染累及眼部的情况有一定的治疗作用。不过，口服药物可能会对肝脏等器官产生一定的负担，需要密切监测肝功能。
5. 伏立康唑注射液：是一种新型的三唑类抗真菌药，抗菌谱广，对多种耐药真菌也有较好的抗菌活性。主要用于治疗侵袭性曲霉病等严重的真菌感染，在眼部严重真菌感染且其他治疗效果不佳时可考虑使用，但使用过程中需要注意监测药物的不良反应。
在使用抗真菌药物治疗眼睛真菌感染时，要根据病情的严重程度、感染的真菌种类等因素，在医生的指导下合理选择药物和用药方法，同时密切关注眼部症状的变化和药物的不良反应。
