一般来说，咳嗽吃头孢还是阿莫西林不能简单地一概而论，这取决于咳嗽的病因等因素。
原理方面，头孢菌素类和青霉素类药物都属于抗生素，主要用于治疗由细菌感染引起的疾病。头孢菌素类抗生素的抗菌谱较广，对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌有较强的杀菌作用；青霉素类抗生素则对革兰氏阳性菌的作用较强，对某些革兰氏阴性菌也有一定的抗菌活性。
如果咳嗽是由肺炎链球菌、溶血性链球菌等革兰氏阳性菌感染引起的，通常使用阿莫西林较为合适，因为阿莫西林属于青霉素类抗生素，对这类细菌有较好的抗菌效果。但如果是由流感嗜血杆菌、大肠埃希菌等革兰氏阴性菌感染，或者是由耐药菌引起的感染，头孢类抗生素可能更适合，因为头孢菌素类抗生素对这些细菌的抗菌活性可能更强。
很多咳嗽并非由细菌感染引起，而是由病毒感染、过敏、气道刺激等因素导致。对于这些原因引起的咳嗽，使用抗生素是无效的，不仅不能缓解咳嗽症状，还可能导致抗生素滥用，增加耐药菌的产生。
注意事项：如果咳嗽持续不缓解或伴有发热、咳痰、呼吸困难等症状，应及时就医，明确咳嗽的病因，在医生的指导下选择合适的治疗药物，不要自行随意使用抗生素。只有明确是细菌感染引起的咳嗽，并且根据药敏试验等结果选择合适的抗生素，才能达到较好的治疗效果。
