肛瘘内口的处理方法有药物治疗、坐浴治疗、挂线疗法、瘘管切开术、肛瘘切除术等。
1. 药物治疗：对于肛瘘内口，可使用抗生素类药物如头孢克肟胶囊、阿莫西林克拉维酸钾片、甲硝唑片等，遵医嘱服用。这些药物能有效抑制和杀灭引起肛瘘感染的细菌，减轻内口及周围组织的炎症，缓解红肿、疼痛等症状，防止感染进一步扩散，为后续治疗创造良好条件，促进内口愈合。
2. 坐浴治疗：采用中药坐浴，如使用苦参汤、祛毒汤等。将药物煎好后，倒入盆中，患者坐在盆上熏蒸，待水温适宜后进行坐浴。通过温热的药力作用于肛瘘内口及肛周，能促进局部血液循环，改善内口周围组织的营养供应，减轻局部充血和炎症，清洁内口及肛周的分泌物，起到消肿止痛、促进内口愈合的效果。
3. 挂线疗法：适用于距离肛门3 - 5cm内，有内外口的低位或高位单纯性肛瘘。利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘内口及瘘管。这种方法能避免一次性切断肛管直肠环而导致肛门失禁，同时持续的压迫使局部组织缺血坏死，逐渐切开瘘管，在切开过程中，周围组织会逐渐愈合，从而达到治疗肛瘘内口的目的。
4. 瘘管切开术：主要针对低位肛瘘。在麻醉下，将瘘管全部切开，使创面完全敞开，引流通畅。通过这种方式，能直接去除内口及瘘管的病变组织，让新鲜的肉芽组织从基底部开始生长，逐渐填满创口，达到愈合的效果，有效解决了因瘘管堵塞、引流不畅导致的肛瘘反复不愈问题。
5. 肛瘘切除术：适用于低位单纯性肛瘘和高位复杂性肛瘘。手术将瘘管及其周围的瘢痕组织一并切除，直至显露健康组织。这种方法能彻底清除内口及瘘管的病变组织，消除感染源，为创口的愈合提供良好的条件，虽然创伤相对较大，但对于一些复杂的肛瘘内口病变能达到根治的目的。
肛瘘内口处理后，要保持肛周清洁，排便后及时清洗。饮食上避免食用辛辣、油腻等刺激性食物，多吃富含膳食纤维的食物，保持大便通畅，防止便秘或腹泻对创面造成刺激。按照要求定期换药，观察创面愈合情况，若出现异常如出血、疼痛加剧等及时就医。
