大拇指甲凹陷可能由多种原因引起，如营养缺乏、外伤、真菌感染、系统性疾病、某些药物副作用等。
1. 营养缺乏：缺乏维生素、矿物质等营养物质可能导致指甲凹陷。如缺乏铁会影响血红蛋白合成，导致指甲变薄、凹陷。建议增加富含这些营养物质的食物摄入，如动物肝脏、瘦肉、蛋类、绿叶蔬菜等。
2. 外伤：指甲受到挤压、碰撞等外伤后，可能出现凹陷。如果只是轻微凹陷，一般无需特殊处理，随着指甲的生长会逐渐恢复正常。
3. 真菌感染：灰指甲等真菌感染可引起指甲变形、凹陷。可使用抗真菌药物治疗，如外用涂抹的药膏或口服药物，具体需根据病情遵医嘱。
4. 系统性疾病：一些系统性疾病，如银屑病、甲状腺疾病等，可能影响指甲的生长和形态，导致指甲凹陷。需针对原发疾病进行治疗。
5. 某些药物副作用：某些药物可能有副作用导致指甲改变，如化疗药物等。如果是药物引起，需在医生指导下调整药物或采取相应措施。
注意事项：如果指甲凹陷持续不缓解或伴有其他不适症状，如疼痛、红肿等，应及时就医，明确病因并进行针对性治疗。同时，要保持良好的生活习惯，避免指甲受到外伤。
