不存在治疗大脚趾灰指甲最好的办法，因为治疗方法需根据患者具体情况选择，适合的才是好的。灰指甲医学上称为甲癣，是由皮肤癣菌侵犯甲板及甲下所引起的疾病。
药物治疗是常用手段。外用药物方面，对于症状较轻、病甲较少的情况适用。比如阿莫罗芬搽剂，它能在甲板表面形成一层保护膜，持续释放药物抑制真菌。使用时要先将病甲尽量锉薄，以利于药物渗透，每周使用 1 - 2 次，坚持数月。口服药物常用于多个指甲受累或外用药物效果不佳时，像伊曲康唑、特比萘芬等。伊曲康唑一般采用冲击疗法，即每天服用一定剂量，连服 1 周，停 3 周为一个疗程，通常需 2 - 3 个疗程；特比萘芬则需每日口服，疗程大概 6 - 12 周。口服药可能有一定副作用，需定期监测肝功能。
手术拔甲是一种较为直接的方式，但相对痛苦且恢复慢。适用于药物治疗无效，或病甲严重增厚、变形，影响日常生活的情况。在局部麻醉下将病甲拔除，后续新甲会逐渐生长。不过术后要注意伤口护理，防止感染。
激光治疗是新兴的治疗手段，通过特定波长的激光能量破坏真菌，具有创伤小、恢复快的优点。但可能需要多次治疗，费用相对较高。
治疗大脚趾灰指甲期间，要保持脚部清洁干燥，勤换鞋袜，避免与他人共用拖鞋、脚盆等生活用品，防止交叉感染。同时，增强自身免疫力，均衡饮食、适当运动，为新甲生长创造良好条件。
