吃辣椒上厕所肛门疼应根据辣椒素刺激、肛裂、痔疮、肛周炎症、肛瘘等病因治疗，可采取的方法有调整饮食、药物治疗、手术治疗等。
1. 辣椒素刺激：食用辣椒后，辣椒素无法被人体完全吸收，会随粪便排出，刺激肛门周围的黏膜和神经末梢，导致疼痛。可通过大量饮水，稀释体内辣椒素浓度；多吃富含膳食纤维的食物，如蔬菜、水果、全谷类，促进肠道蠕动，加快辣椒素排出体外；也可温水坐浴，每次15 - 20分钟，每天2 - 3次，缓解疼痛。
2. 肛裂：本身存在肛裂，吃辣椒后因辣椒素刺激，使肛裂部位疼痛加剧。可遵医嘱使用复方角菜酸酯栓、重组人表皮生长因子凝胶、硝酸酯类药物软膏，促进肛裂愈合，缓解疼痛。同时，要保持大便通畅，避免用力排便，防止加重肛裂。
3. 痔疮：辣椒会使直肠静脉丛充血，加重原本痔疮的症状，引发疼痛。可遵医嘱口服地奥司明片、草木犀流浸液片，外用马应龙麝香痔疮膏、肛泰软膏、云南白药痔疮膏。避免久坐久站，适当运动，促进血液循环。
4. 肛周炎症：肛周皮肤受到细菌等病原体感染引发炎症，吃辣椒后刺激炎症部位导致疼痛。可遵医嘱口服头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊、甲硝唑片，局部用高锰酸钾溶液坐浴，浓度为1：5000，坐浴后涂抹红霉素软膏、莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏。
5. 肛瘘：肛瘘患者吃辣椒后，辣椒素刺激瘘管及周围组织，引起疼痛。症状较轻时，可遵医嘱口服抗生素如头孢呋辛酯片、左氧氟沙星胶囊、阿奇霉素分散片，局部用中药坐浴。若病情严重，通常需手术治疗。
日常要注意饮食清淡，尽量避免食用过多辛辣、刺激性食物，保持肛门清洁卫生，养成良好的排便习惯，避免久坐，适当进行体育锻炼，若疼痛持续不缓解或加重，及时就医。
