三个月的宝宝肚子咕咕响，可能是由多种原因引起的，如胃肠蠕动、饥饿、消化不良、腹部着凉、肠道感染等。
1. 胃肠蠕动：宝宝的胃肠在正常蠕动时，会发出咕咕声，这是一种正常的生理现象，无需特殊处理。
2. 饥饿：当宝宝感到饥饿时，胃肠蠕动会加快，从而导致肚子咕咕响。此时，应及时给宝宝喂奶或添加辅食。
3. 消化不良：宝宝的消化系统尚未发育完善，如果喂养不当或进食过多，可能会引起消化不良，导致肚子咕咕响，还可能伴有腹胀、呕吐等症状。可适当减少喂奶量，给宝宝按摩腹部，促进消化。
4. 腹部着凉：宝宝的腹部受凉后，胃肠功能会受到影响，出现肚子咕咕响的情况，可能还会伴有腹泻。要注意给宝宝保暖，尤其是腹部。
5. 肠道感染：如果宝宝的肚子咕咕响，同时伴有腹泻、发热等症状，可能是肠道感染引起的。应及时就医，进行相关检查和治疗。
如果宝宝肚子咕咕响的情况持续时间较长或伴有其他异常症状，建议及时带宝宝去医院就诊，以便明确原因，进行针对性的治疗。在日常生活中，要注意合理喂养宝宝，保持宝宝的腹部温暖，避免着凉。
