甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶都是治疗甲状腺功能亢进症的常用药物，区别如下：
1.作用机制：甲巯咪唑通过抑制甲状腺过氧化物酶，从而阻碍甲状腺内碘化物的氧化及酪氨酸的偶联，阻碍甲状腺素T4和三碘甲状腺原氨酸T3的合成。丙硫氧嘧啶能抑制甲状腺过氧化物酶系统，使被摄入到甲状腺细胞内的碘化物不能氧化成活性碘，酪氨酸不能碘化；同时，一碘酪氨酸和二碘酪氨酸的缩合过程受阻，以致不能生成甲状腺激素。
2.半衰期：甲巯咪唑的半衰期较长，约为4-6小时。丙硫氧嘧啶的半衰期较短，约为1-2小时。
3.适用人群：甲巯咪唑适用于病情较轻，甲状腺轻至中度肿大的患者。丙硫氧嘧啶适用于病情较重，甲状腺重度肿大的患者，以及甲状腺危象的治疗。
4.不良反应：甲巯咪唑的不良反应主要有皮疹、皮肤瘙痒、白细胞减少等。丙硫氧嘧啶的不良反应主要有头痛、眩晕、关节痛、胃肠道反应、皮疹、皮肤瘙痒等，丙硫氧嘧啶还可能导致肝损害，需要定期检查肝功能。
5.药物相互作用：甲巯咪唑与抗凝药合用，可增强抗凝作用。丙硫氧嘧啶与口服抗凝血药合用可降低后者的疗效。
无论是使用甲巯咪唑还是丙硫氧嘧啶，都需要在医生的指导下进行，严格按照医嘱用药，定期复查甲状腺功能、血常规、肝功能等，以便及时调整治疗方案。
