一般情况下，规范操作的鼻咽拭子不会对鼻子造成明显伤害。但如果操作不当，可能会引起一些不适甚至损伤。
鼻咽拭子是通过特定工具采集鼻腔和咽部样本以检测病原体。在操作时，若医护人员手法熟练、轻柔，按照标准流程进行，大多只会带来短暂的轻微不适，比如鼻腔的酸胀感，很快就能恢复。
若操作不够规范，比如采样力度过大、方向偏差等，可能导致鼻腔黏膜破损、出血，尤其是本身鼻腔黏膜就比较脆弱的人，这种风险相对更高。不过这种情况并不常见，正规医疗机构的医护人员都经过专业培训，能最大程度降低风险。
在进行鼻咽拭子采样前，尽量保持鼻腔清洁，避免用力擤鼻等可能损伤鼻腔黏膜的行为。采样过程中要积极配合医护人员，保持头部稳定，不要随意晃动。采样后若出现鼻腔少量出血，可通过按压鼻翼等简单方式止血。若不适症状持续不缓解或加重，应及时就医，遵循医生的建议进行处理。
