肛瘘术后一般不会导致肛门失禁，但在某些特殊情况下可能出现。肛瘘手术是否引发肛门失禁取决于多种因素。若手术未损伤肛门括约肌等关键结构，通常不会影响肛门正常功能；若手术中对括约肌造成严重损伤，就可能导致不同程度的肛门失禁。
肛瘘手术旨在处理肛瘘病变，恢复肛门直肠周围的健康。手术方式多样，不同方式对肛门功能影响有别。简单肛瘘手术操作相对简单，对括约肌影响小，发生肛门失禁概率低；复杂肛瘘手术因涉及范围广、深度深，手术难度大，损伤括约肌风险增加，进而提高了肛门失禁的可能性。
肛门失禁程度也有所不同，轻微的可能只是对气体控制稍差，严重的则可能完全无法控制排便。术后肛门功能的恢复情况还与患者自身身体状况、术后护理等有关。年轻、身体素质好且术后护理得当的患者，肛门功能恢复往往较好；而年老体弱、有基础疾病且护理不佳的患者，恢复相对困难，肛门失禁风险也会相应增加。
肛瘘术后要重视护理。保持伤口清洁，按要求进行坐浴，促进局部血液循环，利于伤口愈合。饮食上，避免食用辛辣、油腻等刺激性食物，多吃富含膳食纤维的食物，保持大便通畅，防止便秘或腹泻对肛门造成不良影响。同时，要遵循医生的康复指导，定期复查，以便及时发现并处理可能出现的问题。
