治疗生殖器疱疹的药物有阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦、膦甲酸钠、西多福韦等。
1. 阿昔洛韦：是治疗生殖器疱疹的常用药物，能抑制病毒DNA多聚酶，阻碍病毒DNA合成，从而达到抗病毒效果。可口服给药，对于初发生殖器疱疹，一般疗程为7 - 10天；对于频繁复发者，需长期抑制治疗，可减少复发次数。
2. 伐昔洛韦：是阿昔洛韦的前体药物，口服后迅速吸收并转化为阿昔洛韦发挥作用。生物利用度高，服用方便，疗效与阿昔洛韦相似，但用药次数相对较少，同样适用于初发和复发性生殖器疱疹的治疗。
3. 泛昔洛韦：在体内代谢为有活性的喷昔洛韦，对单纯疱疹病毒有良好的抑制作用。其抗病毒谱与阿昔洛韦相似，可有效缓解生殖器疱疹症状，缩短病程，减少病毒排放时间。
4. 膦甲酸钠：主要用于对阿昔洛韦耐药的病毒感染。通过抑制病毒DNA多聚酶的焦磷酸结合部位，阻止病毒核酸合成。通常采用静脉滴注给药，使用时需注意监测不良反应。
5. 西多福韦：对多种DNA病毒有抑制作用，可用于治疗耐阿昔洛韦的单纯疱疹病毒感染。一般为静脉注射给药，不过其不良反应相对较多，使用时需谨慎评估。
治疗生殖器疱疹需严格按医嘱用药，足量、足疗程治疗，不可自行增减药量或停药。治疗期间应保持患处清洁、干燥，避免性生活，防止交叉感染。同时，要注意休息，加强营养，增强机体免疫力，以促进疾病康复。
