肛瘘肛周脓肿的治疗方法有药物治疗、手术治疗、中医治疗等。
1. 药物治疗：适用于症状较轻或脓肿初期，主要采用抗生素类药物，如头孢菌素、甲硝唑等，通过抑制或杀灭细菌，控制感染扩散，缓解炎症症状。同时可配合外用药物，如金黄膏、鱼石脂软膏等，涂抹于肛周，起到消肿止痛、清热解毒的作用。
2. 手术治疗：是主要的治疗方式。切开引流术，能及时排出脓肿内的脓液，减轻局部压力，缓解疼痛，防止感染进一步蔓延。肛瘘切开术或切除术，针对肛瘘形成后的情况，直接切除瘘管组织，达到根治目的。挂线疗法常用于高位肛瘘，利用橡皮筋或药线的慢性切割作用，避免一次性切断括约肌导致肛门失禁。
3. 中医治疗：中医可通过内服中药，依据患者具体症状、体征进行辨证论治，以清热利湿、解毒排脓等为原则，调整机体阴阳平衡，增强抵抗力。还可采用中药坐浴，如苦参汤等，通过温热药液的作用，促进局部血液循环，减轻炎症反应，缓解疼痛。
治疗后要保持肛周清洁，排便后用温水清洗，避免局部摩擦。饮食上，避免食用辛辣、油腻等刺激性食物，多吃富含膳食纤维的食物，保持大便通畅。同时，要注意休息，避免久坐、久站，适当进行体育锻炼，增强体质，促进恢复。严格按照医生嘱咐定期换药、复查，以便及时发现并处理可能出现的问题 。
