治疗生殖器疣的方法有药物治疗、物理治疗、手术治疗、免疫治疗、中医治疗等。
1. 药物治疗：适用于疣体较小、不宜采用物理治疗的情况。常用药物如鬼臼毒素酊，可抑制疣体细胞有丝分裂，促使疣体坏死脱落；咪喹莫特乳膏，能诱导机体产生免疫反应，发挥抗病毒作用，达到清除疣体目的。
2. 物理治疗：是较为常用的方法。冷冻治疗利用液氮低温使疣体组织坏死脱落；激光治疗通过高温碳化疣体；电灼治疗则借助高频电流破坏疣体组织，这些方法能快速去除可见疣体。
3. 手术治疗：对于疣体较大、药物和物理治疗效果不佳时可采用。如疣体切除术，直接将疣体完整切除，能有效去除病变组织，但术后可能会留下瘢痕。
4. 免疫治疗：通过调节机体免疫系统来对抗病毒。如干扰素，可增强机体免疫细胞活性，提高抗病毒能力，降低复发几率。
5. 中医治疗：中医多采用清热解毒、燥湿除疣的中药进行治疗，可口服中药汤剂，也可采用中药坐浴等外治方法，从整体调节机体状态，达到治疗目的。
治疗生殖器疣后要保持患处清洁干燥，避免搔抓以防感染。治疗期间应避免性生活，防止交叉感染。同时，要注意休息，加强营养，适当锻炼，增强自身免疫力。严格按照医生的嘱咐定期复查，以便及时发现复发并进行处理。
