囊胚流产后可通过药物治疗、观察等待、清宫手术、抗感染治疗、心理疏导等方法处理。
1. 药物治疗：囊胚流产后，遵医嘱使用益母草颗粒、新生化颗粒、五加生化胶囊，这些药物能促进子宫收缩，帮助排出宫腔内残留的组织，减少出血，促使子宫尽快恢复正常状态，对于囊胚流产后子宫复旧不良等情况有较好的改善作用，让身体能更快从流产状态恢复。
2. 观察等待：对于囊胚流产后阴道出血量不多，超声提示宫腔内残留组织较少的情况，可进行观察等待。在此期间密切关注阴道出血情况、有无腹痛等症状。身体自身可能会逐渐将残留组织排出体外，若能自然排出且无异常症状，可避免进一步的干预措施。
3. 清宫手术：若囊胚流产后有较多组织残留于宫腔内，导致出血量大或持续时间长，此时需进行清宫手术。通过手术器械将宫腔内残留的胚胎组织清除干净，从而达到止血、避免感染等目的，防止因残留组织引发一系列并发症，保障子宫的正常功能。
4. 抗感染治疗：囊胚流产后身体抵抗力下降，容易发生感染。遵医嘱使用头孢克肟分散片、甲硝唑片、阿奇霉素胶囊，这些药物能有效预防和控制感染，避免因感染引发子宫内膜炎、盆腔炎等疾病，防止对生殖系统造成进一步损害，利于身体恢复健康。
5. 心理疏导：囊胚流产对患者心理会造成一定创伤。通过与家人、朋友交流沟通，或寻求专业心理咨询师的帮助，缓解焦虑、悲伤等不良情绪，正确认识此次经历，保持积极的心态，对身体和心理的双重恢复都有重要意义。
囊胚流产后要注意休息，保证充足睡眠，避免过度劳累。饮食上多摄入富含营养的食物，如瘦肉、鱼类、蛋类、新鲜蔬果等，促进身体恢复。注意个人卫生，保持外阴清洁，一个月内禁止性生活和盆浴，防止感染。按医嘱定期复查，了解身体恢复情况。
