基孔肯雅热需要与登革热、疟疾、风湿热、类风湿关节炎、恙虫病等鉴别。
1. 登革热：二者均由蚊虫传播，临床症状有相似之处，都可能出现发热、皮疹、关节疼痛等表现。但登革热的疼痛多为肌肉和骨骼疼痛，相对关节痛不如基孔肯雅热明显，且登革热还可能出现出血倾向，如鼻出血、牙龈出血等，通过血清学检测、病毒核酸检测等可进行区分。
2. 疟疾：疟疾也以周期性发作的寒战、高热、大汗为特点，易与基孔肯雅热混淆。不过疟疾的发热规律更为典型，且一般无明显的关节疼痛和皮疹，通过血涂片查找疟原虫可明确诊断。
3. 风湿热：风湿热多累及大关节，呈游走性疼痛，可伴有心脏炎、环形红斑、皮下结节等表现。与基孔肯雅热不同的是，风湿热通常有前驱的链球菌感染病史，抗链球菌溶血素O等相关检查有助于鉴别。
4. 类风湿关节炎：类风湿关节炎以对称性多关节肿胀、疼痛、畸形为主要特征，多侵犯小关节，病情呈慢性进行性发展。而基孔肯雅热关节症状多在急性发热期出现，通过类风湿因子、抗环瓜氨酸肽抗体等检查可辅助鉴别。
5. 恙虫病：恙虫病有发热、焦痂或溃疡、淋巴结肿大及皮疹等表现，与基孔肯雅热有重叠。但恙虫病有野外草地接触史，可发现特征性焦痂，血清学检查有助于区分。
若出现发热、关节疼痛等不适症状，应及时就医。医生会综合症状、病史及各项检查结果进行准确诊断。患者需积极配合检查与治疗，治疗期间注意休息，避免劳累，保持良好的生活习惯和心态，促进身体恢复。
