肛门病毒疣通常不能自愈。
肛门病毒疣由人乳头瘤病毒HPV感染引起，病毒会在皮肤黏膜细胞内不断复制、繁殖，刺激细胞异常增生和分化，从而形成疣体。人体自身免疫系统虽有一定防御和清除病原体的能力，但对于已经引发肛门病毒疣的HPV感染，往往难以将其彻底清除。
肛门部位环境特殊，温暖潮湿，适宜病毒生存和繁殖，使得病毒更容易持续存在并导致疣体不断生长、增多。而且，肛门病毒疣若不及时干预，不仅不会自行消失，还可能逐渐增大、扩散，甚至引发其他并发症，严重影响身体健康。
在日常生活中，要保持肛门部位清洁干燥，勤换内裤，避免局部摩擦和刺激。选择宽松、透气的棉质内裤，减少紧身衣物对肛门的压迫。同时，避免高危性行为，防止病毒再次感染或传播给他人。应及时前往医院，在专业医生指导下进行规范治疗，以促进病情康复。
