HPV疫苗第二针推迟45天打会影响药效，HPV疫苗应按正常时间注射，但如果出现特殊情况，最晚也应该不要推迟超过一个月。疫苗种类不同接种的时间也是不同，具体如下：
1.二价疫苗接种时间
二价HPV疫苗原则上要在半年之内注射完三针，注射完第一针后，过一个月注射第二针，第六个月注射第三针。三针间隔的时间是固定的，根据大量的临床数据分析之后判断的时间，可以巩固宫颈癌疫苗的作用，效果发挥到最好，避免宫颈癌的发生。如果打二针推迟的时间不宜过长，不要超过半个月，否则会影响疫苗的作用效果，降低疫苗的作用，建议按疗程规律用药。
2.四价、九价疫苗接种时间
四价和九价HPV疫苗原则上是要在半年之内注射完三针，第一针打了以后，两个月后打第二针，第三针是在第六个月。原则上是不能推迟的，因为每一针疫苗的记忆功能和效果都是挂钩的，如果推迟极有可能会导致疫苗原有的效果受到影响。但如果遇到月经期或者生病等情况，需要推迟打针，但是应当尽量缩短推迟的时间避免对疫苗的原有防御效果造成影响。
