根尖囊肿手术完嘴里绿色发臭的黏液有可能是牙龈炎、反流性食管炎、肺结核等原因引起的，可以采用冲洗牙龈、使用药物等方法治疗。
1.牙龈炎：做完根管囊肿手术后，如果不注意局部的护理工作，导致牙龈发炎时，可能会出现嘴里面有绿色发臭的黏液，另外还会伴有局部红肿或者是疼痛的情况，可以遵医嘱使用氧化氢溶液冲洗牙龈、口服阿莫西林胶囊、头孢氨苄颗粒等药物，帮助炎症的消退。
2.反流性食管炎：做完根尖囊肿手术后如果不注意饮食习惯，经常吃刺激性的食物，导致食管部位受到炎症感染，可能会诱发反流性食管炎，从而造成嘴巴里面有绿色发臭的黏液排出。可以配合医生的指导口服奥美拉唑肠溶胶囊或者是盐酸伊托必利片等药物进行治疗。
3.肺结核：如果患者本身就患有肺结核等疾病，做完根尖囊肿手术后，病情发作时也有可能会出现嘴里面有绿色发臭的黏液，伴有反复咳嗽、咳痰的症状。需要遵医嘱使用抗结核类的药物进行治疗，常用药物有吡嗪酰胺片、盐酸乙胺丁醇片以及异烟肼片等。
做完根尖囊肿手术后要定期到医院做复查，调整好饮食习惯，多吃一些清淡易消化的食物，比如小米粥、八宝粥等。避免吃辣椒、生姜或者是大蒜等刺激性的食物。
