百日咳的治疗方法包括一般治疗、抗菌治疗、对症治疗、并发症治疗以及中医治疗等。
1.一般治疗：保持室内安静、空气新鲜和适当温度、湿度。半岁以下婴儿常突然发生窒息，应有专人守护。保持呼吸道通畅，及时清除呼吸道分泌物。
2.抗菌治疗：抗菌治疗可清除鼻咽部的病原体，减少传播，痉咳期使用通常不能缩短病程。常用药物为红霉素、氨苄西林等。
3.对症治疗：痉咳剧烈者可给镇静剂，如苯巴比妥钠、地西洋等。沙丁胺醇亦能减轻咳嗽，可以试用。
4.并发症治疗：并发肺炎可选用敏感抗生素，并发脑病时可给予脱水、止痉等对症处理。
5.中医治疗：中医称百日咳为顿咳，根据不同阶段进行辨证论治，如痉咳期以清热泻肺、化痰降逆为主，恢复期以养阴润肺、益气健脾为主。
在治疗百日咳的过程中，患者应注意休息，加强营养，保持良好的心态。同时，要严格按照医生的建议进行治疗，按时服药，定期复查，以确保病情得到有效控制和恢复。
