肛瘘手术后恢复时间一般在2 - 3个月。低位单纯性肛瘘恢复时间通常较短，多在2周左右；而高位复杂性肛瘘恢复时间相对较长，可能需要2 - 3个月。
肛瘘手术恢复时间受多种因素影响。手术创面大小是关键因素之一，创面越大，愈合所需时间就越长。比如低位单纯性肛瘘，其瘘管位置浅、范围小，手术对组织的损伤相对较小，所以恢复起来较快。而高位复杂性肛瘘，瘘管位置深且分支多，手术创面大，涉及的组织修复范围广，自然恢复时间就会延长。
患者自身的身体状况也对恢复有重要作用。如果患者身体素质较好，新陈代谢快，自身的修复能力强，术后身体能更快地启动修复机制，促进伤口愈合。相反，若患者存在一些基础疾病，如糖尿病，会影响身体的正常代谢和免疫功能，导致伤口愈合缓慢，恢复时间也就会相应增加。术后的护理情况也不容忽视。保持伤口清洁，避免感染，能为伤口愈合创造良好的环境，有助于缩短恢复时间；若护理不当，引发感染，不仅会延缓恢复，还可能引发其他并发症。
肛瘘手术后要注意保持肛门清洁，勤换内裤，排便后可使用温水坐浴，促进局部血液循环，利于伤口愈合。饮食上，多吃富含膳食纤维的食物，保持大便通畅，避免大便干结或腹泻对伤口造成刺激。同时，要严格按照医生的嘱咐定期换药和复查，以便及时了解伤口的恢复情况，出现问题能及时处理。
