婴儿棉签掏鼻孔的危害有鼻腔出血、鼻子正常防卫功能受损；另外会引起颅内感染、肺部感染。
一、鼻腔内的危害
1.鼻腔出血
由于宝宝鼻腔内有十分丰富的血管，如果使用棉签给宝宝挖鼻屎就很容易破坏鼻前庭的血管，而潜在的出血区，受到轻微的外伤就会引起鼻出血；
2.鼻子正常防卫功能受损
如果使用棉签给宝宝挖鼻，是很容易造成局部损伤，破坏鼻腔的正常防卫功能，容易着凉感冒； 因为鼻涕鼻屎可以防止鼻腔黏膜干燥，而且湿润的鼻腔环境能够粘住由空气中吸入的灰尘、花粉，作为一道屏障，可以避免外界的刺激引致宝宝呼吸道的感染。
二、其它部位的危害
1.颅内感染
由于人体鼻部静脉与颅内静脉是相通的，如果使用棉签挖鼻屎，容易导致细菌通过鼻腔进入导致鼻腔感染，从而通过静脉进入颅内，引发致命的颅内感染危及生命。
2.肺部感染
由于宝宝的鼻粘膜很脆弱，使用棉签挖鼻孔，可能会导致鼻黏膜萎缩、分泌物减少，鼻腔的防御功能下降或者丧失，就容易导致一系列的呼吸系统疾病，如慢性咽炎、鼻窦炎，甚至肺部感染等。
