根除幽门螺杆菌失败后，再次进行治疗的方案，采用经典的铋剂四联方案的拓展方法，在铋剂加质子泵抑制剂加阿莫西林的治疗方案中，纳入含有呋喃唑酮或四环素的方法，或采用质子泵抑制剂加阿莫西林加氟喹诺酮类药物加铋剂的四联疗法作为辅助治疗，或根据幽门螺杆菌培养和药敏试验的结果调整治疗方案。
失败后再次治疗时需评估根除治疗的风险-获益比，根除前停用质子泵抑制剂不少于两周，停服抗生素和铋剂不少于4周，作为补救治疗，建议应间隔2~3个月进行，在根除方案中，抑酸药应选择抑酸作用强，疗效高，受细胞色素酶基因多态性影响较小的质子泵抑制剂，如艾司奥美拉唑，雷贝拉唑等提高再次治疗的根除率。
