慢性结肠炎在中医里面归属于泄泻和腹痛的范畴，泄泻是指因感受外邪，或被饮食所伤，或情志失调，或脾胃虚弱，或脾肾阳虚等原因引起的以排便次数增多，粪便稀溏，甚至泄如水样为主证的病证。一般根据病因病机运用淡渗，升提，清凉，疏利，甘缓，酸收，燥脾，温肾，固涩的方法治疗。辩证论治要点如下：
1.腹泻：辨证论治后实证为寒湿或者湿热导致，湿热主要治则是清热化湿。寒湿多为温阳化湿气，虚证主要是脾胃虚弱和阴虚，脾胃虚弱，则补益脾气，调理脾胃，阴虚则养阴。
2.腹痛：不通则痛，故而腹痛病人多采取通导治疗。如果有便秘的情况，则通便(润肠通便、补气通便、补血通便)为主。根据患者的证候、舌苔象、脉象等综合辨证之后，再根据病因给予治疗。根据辩证分型给予燥湿清热、升清止痢治法，方剂主要用葛根芩连汤加减;养阴透热，方剂用青蒿鳖甲汤加减;益气健脾、渗湿止泻，方剂可用参苓白术丸加减;温中祛寒，回阳救逆。方剂可用四逆汤和四神汤加减。
中医药理论对于慢性结肠炎的诊治具有独特优势，通过中医辩证分型有效施治，配合饮食调理、日常护理、西药治疗等治疗手段，慢性结肠炎患者治疗可以取得较好的效果。
