发现轻微甲状腺萎缩可采用一般治疗、药物治疗、手术治疗等方法处理。
1.一般治疗：针对症状轻微的甲状腺萎缩患者，在没有影响甲状腺功能时不用进行特殊治疗，但要定期去医院复诊检查，观察甲状腺功能变化，发现异常及时处理。
2.药物治疗：如症状方面持续进展，且甲状腺激素分泌异常，已经出现甲状腺功能减退的情况，这种情况需及时补充甲状腺激素，遵医嘱服用左甲状腺素钠片、甲巯咪唑片等，用药后可维持甲状腺功能，控制病情进展。
3.手术治疗：部分患者迟迟得不到有效治疗，因此甲状腺萎缩持续加重，对此需考虑甲状腺全切除术治疗，术后遵医嘱定期复诊检查，观察甲状腺恢复的具体情况。
除此之外，患者需密切监测甲状腺功能，同时提高生活质量，同时控制好日常饮食。
